Computational Biology

The Computational Biology Group focuses on the structure, dynamics, and function of biological membrane mimics, including e.g. lipid-protein interactions, membrane (nano-)domain formation, and (membrane) protein oligomerization studied both in atomistic and coarse-grained molecular dynamics simulations (Biological Membrane Biophysics).

22SEP. 2026
Allgemein
Poster presenation at NHR Conference
At day 2 at the NHR Conference 2026 in Paderborn our PhD student Eren Tunç presented MemBack (https://doi.org/10.64898/2026.08.19.745274), a Graph Neural Network based tool that converts fast, simplified (coarse-grained Martini 3) computer simulations of cell membranes back into fully detailed, atom-by-atom (CHARMM36) models.
Mehr lesen über Poster presenation at NHR Conference
15SEP. 2026
Allgemein
NHR conference 2026 in Paderborn
The Computational Biology group is being represented by the PhD students Marius Trollmann and Eren Tunc at this year’s Nationales Hochleistungsrechnen (NHR) conference. On day one Marius presented his work (in collaboration with Paolo Rosetti and Prof. Böckmann) on Lipid Nanoparticles (LNPs). Using large-scale all-atom constant-pH molecular dynamics (CpHMD) simulations on the high-performance computing infrastructure of Erlangen […]The Computational Biology group is being represented by the PhD students Marius Trollmann and Eren Tunc at this year’s Nationales Hochleistungsrechnen (NHR) conference. On day one Marius presented his work (in collaboration with Paolo Rosetti and Prof. Böckmann) on Lipid Nanoparticles (LNPs). Using large-scale all-atom constant-pH molecular dynamics (CpHMD) simulations on the high-performance computing infrastructure of Erlangen […]
Mehr lesen über NHR conference 2026 in Paderborn
31JULI 2026
Allgemein
The missing link: How Piccolino recruits synaptic vesicles to the ribbon synapse
Retinal photoreceptors transmit light signals to their postsynaptic neurons with high precision, speed and without fatigue. This high-throughput neurotransmission relies on a sophisticated molecular machinery centered on a presynaptic organelle, the synaptic ribbon (SR). A hallmark of SRs is the recruitment of synaptic vesicles (SVs) from the cytoplasmic SV pool via “tethering”. However, the identity […]Retinal photoreceptors transmit light signals to their postsynaptic neurons with high precision, speed and without fatigue. This high-throughput neurotransmission relies on a sophisticated molecular machinery centered on a presynaptic organelle, the synaptic ribbon (SR). A hallmark of SRs is the recruitment of synaptic vesicles (SVs) from the cytoplasmic SV pool via “tethering”. However, the identity […]
Mehr lesen über The missing link: How Piccolino recruits synaptic vesicles to the ribbon synapse
05JULI 2026
Allgemein
Der pH-Schalter moderner mRNA-Impfstoffe
Moderne Impfstoffe müssen Alleskönner sein: Sie sollen klassische Infektionskrankheiten verhindern, Krebs bekämpfen, effizient und flexibel produziert werden können sowie ein hohes Sicherheitsprofil mit möglichst wenigen Nebenwirkungen aufweisen. mRNA-basierte Impfstoffe gehören derzeit zu den vielversprechendsten Ansätzen, um all diese Anforderungen zu erfüllen. Besonders während der SARS-CoV-2-Pandemie hat sich das große Potenzial dieser Technologie gezeigt. Die größte […]Moderne Impfstoffe müssen Alleskönner sein: Sie sollen klassische Infektionskrankheiten verhindern, Krebs bekämpfen, effizient und flexibel produziert werden können sowie ein hohes Sicherheitsprofil mit möglichst wenigen Nebenwirkungen aufweisen. mRNA-basierte Impfstoffe gehören derzeit zu den vielversprechendsten Ansätzen, um all diese Anforderungen zu erfüllen. Besonders während der SARS-CoV-2-Pandemie hat sich das große Potenzial dieser Technologie gezeigt. Die größte […]
Mehr lesen über Der pH-Schalter moderner mRNA-Impfstoffe
22JUNI 2026
Allgemein
Herzlichen Glückwunsch an Marius Trollmann zum ISQBP Award 2026 für die beste Posterpräsentation!
Sein Poster „Decoding pH-Driven Phase Transitions of Lipid Nanoparticles Through Constant‑pH‑Simulations“ hebt unsere Arbeit hervor, in der wir untersuchen, wie Protonierungsgleichgewichte die Struktur und das Phasenverhalten von Lipidnanopartikeln prägen und wie die Lipidumgebung die Protonierungsgleichgewichte von Aminolipiden verschiebt. Eine wohlverdiente Auszeichnung — herzlichen Glückwunsch, Marius!Sein Poster „Decoding pH-Driven Phase Transitions of Lipid Nanoparticles Through Constant‑pH‑Simulations“ hebt unsere Arbeit hervor, in der wir untersuchen, wie Protonierungsgleichgewichte die Struktur und das Phasenverhalten von Lipidnanopartikeln prägen und wie die Lipidumgebung die Protonierungsgleichgewichte von Aminolipiden verschiebt. Eine wohlverdiente Auszeichnung — herzlichen Glückwunsch, Marius!
Mehr lesen über Herzlichen Glückwunsch an Marius Trollmann zum ISQBP Award 2026 für die beste Posterpräsentation!
11MAI 2026
Allgemein
Promotion von Matthias Pöhnl mit Auszeichnung abgeschlossen
Wir gratulieren Dr. Matthias Pöhnl herzlich zum erfolgreichen Abschluss seiner Promotion in der Arbeitsgruppe Computational Biology an der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg. Seine Dissertation mit dem Titel “From Membrane Mechanics to Immune Regulation: Molecular Simulations of Lipid-Protein Interplay” verteidigte er erfolgreich im Rahmen seiner Disputation am 8. Mai 2026.Die Arbeit verbindet moderne molekulardynamische Simulationen biologischer Membranen mit […]Wir gratulieren Dr. Matthias Pöhnl herzlich zum erfolgreichen Abschluss seiner Promotion in der Arbeitsgruppe Computational Biology an der Friedrich-Alexander-Universität Erlangen-Nürnberg. Seine Dissertation mit dem Titel “From Membrane Mechanics to Immune Regulation: Molecular Simulations of Lipid-Protein Interplay” verteidigte er erfolgreich im Rahmen seiner Disputation am 8. Mai 2026.Die Arbeit verbindet moderne molekulardynamische Simulationen biologischer Membranen mit […]
Mehr lesen über Promotion von Matthias Pöhnl mit Auszeichnung abgeschlossen

Events

Keine bevorstehenden Veranstaltungen.